Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms