Protein–RNA interactions for Protein: P30926

CHRNB4, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB4P30926 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNB4P30926 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms