Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GLI2P10070 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GLI2P10070 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
GLI2P10070 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GLI2P10070 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GLI2P10070 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GLI2P10070 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GLI2P10070 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GLI2P10070 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GLI2P10070 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GLI2P10070 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GLI2P10070 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GLI2P10070 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GLI2P10070 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GLI2P10070 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GLI2P10070 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GLI2P10070 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GLI2P10070 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GLI2P10070 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GLI2P10070 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GLI2P10070 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GLI2P10070 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GLI2P10070 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GLI2P10070 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GLI2P10070 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GLI2P10070 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GLI2P10070 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GLI2P10070 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
GLI2P10070 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GLI2P10070 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GLI2P10070 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GLI2P10070 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GLI2P10070 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GLI2P10070 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GLI2P10070 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GLI2P10070 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GLI2P10070 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GLI2P10070 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GLI2P10070 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GLI2P10070 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GLI2P10070 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GLI2P10070 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GLI2P10070 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GLI2P10070 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GLI2P10070 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
GLI2P10070 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GLI2P10070 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GLI2P10070 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GLI2P10070 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GLI2P10070 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GLI2P10070 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GLI2P10070 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GLI2P10070 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GLI2P10070 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GLI2P10070 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GLI2P10070 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GLI2P10070 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GLI2P10070 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GLI2P10070 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GLI2P10070 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GLI2P10070 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GLI2P10070 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GLI2P10070 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GLI2P10070 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GLI2P10070 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GLI2P10070 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GLI2P10070 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GLI2P10070 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GLI2P10070 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GLI2P10070 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GLI2P10070 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GLI2P10070 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GLI2P10070 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GLI2P10070 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GLI2P10070 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GLI2P10070 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GLI2P10070 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GLI2P10070 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GLI2P10070 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GLI2P10070 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GLI2P10070 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GLI2P10070 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GLI2P10070 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GLI2P10070 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
GLI2P10070 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GLI2P10070 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI2P10070 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI2P10070 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI2P10070 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI2P10070 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI2P10070 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI2P10070 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI2P10070 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI2P10070 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI2P10070 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI2P10070 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI2P10070 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI2P10070 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI2P10070 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI2P10070 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms