Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC9Q9UKV0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms