Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms