Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPS8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPS8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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