Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan1Q99J59 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms