Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms