Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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