Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM43BQ6ZT52 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms