Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF7Q6Q0C0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF7Q6Q0C0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms