Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcf4Q60722 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tcf4Q60722 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tcf4Q60722 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tcf4Q60722 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tcf4Q60722 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tcf4Q60722 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tcf4Q60722 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tcf4Q60722 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms