Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
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