Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
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