Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MitfQ08874 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MitfQ08874 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms