Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX6P78412 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX6P78412 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX6P78412 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX6P78412 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX6P78412 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX6P78412 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX6P78412 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX6P78412 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX6P78412 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX6P78412 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX6P78412 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX6P78412 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX6P78412 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX6P78412 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX6P78412 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX6P78412 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX6P78412 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX6P78412 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX6P78412 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX6P78412 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX6P78412 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX6P78412 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX6P78412 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX6P78412 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX6P78412 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX6P78412 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX6P78412 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX6P78412 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX6P78412 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX6P78412 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX6P78412 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX6P78412 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX6P78412 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX6P78412 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX6P78412 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX6P78412 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX6P78412 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX6P78412 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX6P78412 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX6P78412 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX6P78412 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX6P78412 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX6P78412 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms