Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1bP70700 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms