Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tac1P41539 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tac1P41539 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tac1P41539 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tac1P41539 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tac1P41539 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tac1P41539 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tac1P41539 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tac1P41539 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tac1P41539 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tac1P41539 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tac1P41539 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tac1P41539 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tac1P41539 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tac1P41539 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tac1P41539 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tac1P41539 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tac1P41539 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tac1P41539 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tac1P41539 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms