Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc10P31257 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms