Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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