Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms