Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01644 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01644 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01644 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01644 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01644 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01644 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01644 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01644 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01644 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01644 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01644 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01644 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01644 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01644 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01644 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01644 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01644 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01644 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01644 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01644 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01644 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01644 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01644 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01644 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01644 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01644 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01644 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
P01644 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01644 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01644 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01644 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01644 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01644 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01644 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01644 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01644 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01644 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01644 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01644 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01644 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01644 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01644 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01644 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01644 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01644 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01644 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01644 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01644 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01644 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01644 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01644 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01644 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01644 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01644 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01644 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01644 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01644 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01644 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01644 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms