Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CEP290O15078 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CEP290O15078 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CEP290O15078 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CEP290O15078 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CEP290O15078 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CEP290O15078 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CEP290O15078 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CEP290O15078 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CEP290O15078 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CEP290O15078 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CEP290O15078 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CEP290O15078 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CEP290O15078 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CEP290O15078 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CEP290O15078 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CEP290O15078 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CEP290O15078 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CEP290O15078 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CEP290O15078 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CEP290O15078 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CEP290O15078 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CEP290O15078 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CEP290O15078 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CEP290O15078 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CEP290O15078 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP290O15078 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP290O15078 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP290O15078 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP290O15078 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP290O15078 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP290O15078 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP290O15078 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP290O15078 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP290O15078 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP290O15078 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP290O15078 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP290O15078 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP290O15078 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP290O15078 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP290O15078 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP290O15078 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP290O15078 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP290O15078 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP290O15078 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP290O15078 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP290O15078 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms