Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVH48-1M5A8F1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVH48-1M5A8F1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms