Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms