Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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