Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.4 ms