Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USH1CQ9Y6N9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms