Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B9

SUPT16H, FACT complex subunit SPT16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT16HQ9Y5B9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SUPT16HQ9Y5B9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUPT16HQ9Y5B9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUPT16HQ9Y5B9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUPT16HQ9Y5B9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUPT16HQ9Y5B9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUPT16HQ9Y5B9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms