Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms