Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubb4aQ9D6F9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4aQ9D6F9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms