Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Rpl39lQ9CQD0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Rpl39lQ9CQD0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Rpl39lQ9CQD0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl39lQ9CQD0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl39lQ9CQD0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl39lQ9CQD0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl39lQ9CQD0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl39lQ9CQD0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl39lQ9CQD0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl39lQ9CQD0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl39lQ9CQD0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl39lQ9CQD0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl39lQ9CQD0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rpl39lQ9CQD0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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