Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM6SF1Q9BZW5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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