Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COG3Q96JB2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms