Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4CQ96DT6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms