Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Impg1Q8R1W8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Impg1Q8R1W8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Impg1Q8R1W8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Impg1Q8R1W8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Impg1Q8R1W8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Impg1Q8R1W8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Impg1Q8R1W8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Impg1Q8R1W8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Impg1Q8R1W8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Impg1Q8R1W8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Impg1Q8R1W8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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