Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGF0

AW551984, Expressed sequence AW551984, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW551984Q8BGF0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AW551984Q8BGF0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms