Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms