Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms