Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx1P81068 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx1P81068 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms