Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms