Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RCC1P18754 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCC1P18754 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCC1P18754 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCC1P18754 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms