Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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