Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04213 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04213 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04213 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04213 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04213 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P04213 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04213 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P04213 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04213 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04213 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04213 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04213 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04213 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04213 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04213 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P04213 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04213 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04213 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04213 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04213 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04213 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04213 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P04213 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P04213 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P04213 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P04213 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P04213 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04213 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04213 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04213 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04213 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04213 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04213 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04213 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04213 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04213 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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