Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnkO88874 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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