Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms