Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms