Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRCP1A6NGW2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms