Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP3Q9Y6F1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms