Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms